Le Bobtail Japonais est installé au Japon depuis de nombreux siècles puisqu’il est déjà présent dans des peintures antiques. C’est un petit félin qui ne porte pas, comme beaucoup d’autres chats, la marque de la sélection humaine. Il a passé tous ces siècles sans s’éloigner des plus anciennes représentations que l’on a de lui. Il a vraisemblablement été importé de Corée au Japon au 6ème siècle pour protéger les manuscrits des souris. Un temple lui est d’ailleurs consacré dans la banlieue de Tokyo, le temple de Gotokuji. Il a toujours fait partie intégrante de l’art au Japon et de la culture japonaise.
Le moment de la mutation génétique liée à l’aspect si caractéristique de sa queue ne peut être identifié et remonte vraisemblablement à l’époque préhistorique. C’est en 1968 que Elizabeth Freret importe les trois premiers Bobtail Japonais aux Etats-Unis et il n’aura fallu que huit ans pour qu’il soit reconnu comme une race à part entière dans les expositions. Si le Bobtail Japonais à poils longs a toujours naturellement existé en Orient (plus fréquemment dans les régions nordiques du Japon), aux côtés de son frère à poils courts, il n’a été reconnu quant à lui, qu’en 1993 par la CFA.
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